Le prince de Perse retourne dans son royaume pour le trouver décimé par la guerre et retourné contre lui dans Prince of Persia : Les Deux Trônes. Vous pouvez incarner le prince qui maîtrise le temps ou son alter ego maléfique alors qu'il tente de retourner sur le trône qui lui revient de droit.
Il y a désormais deux personnages distincts, chacun avec ses propres capacités et antécédents, alors que vous explorez le cadre urbain de Babylone. Prince of Persia : Les Deux Trônes ajoute de nouvelles capacités des Sables du Temps et un tout nouveau décor pour le troisième chapitre de l'histoire de Prince of Persia.