Avec des avions sous licence tels que le F-14D et le Tornado F3, et un système d'IA stratégique où le cours des actions du joueur affecte directement ses objectifs de mission, Ace Combat X: Skies of Deception permet au joueur de jouer le rôle d'un pilote d'as essayant de libérer son pays d'origine d'Aurelia de son voisin, Leasath. Un pays rempli de motifs secrets voilés derrière de longs conflits internes, Leasath, a envahi et pris le contrôle d'Aurelia. Défendant le pays envahi, la mission du joueur est de les emmener dans les cieux remplis de batailles afin d'abattre l'ennemi et de restaurer la liberté et la paix dans sa patrie. Pour compléter la liste des fonctionnalités, Ace Combat X: Skies of Deception permet aux joueurs de régler leurs avions d'origine avec des pièces déverrouillées en mode Campagne pour améliorer encore leur expérience de vol.