La version console de Championship Manager 2006 est à bien des égards similaire à la version PC. Les joueurs sélectionnent un club dans l'un des nombreux pays différents et jouent le rôle de manager, en prenant en charge la tactique, l'entraînement, la signature de nouveaux joueurs, la négociation de contrats, etc.

Le jeu est très lourd en statistiques et suppose une connaissance assez approfondie du football, le définissant à part ses concurrents plus accessibles. Depuis que cette version est sortie quelques mois après la version PC, elle présente des statistiques mises à jour pour refléter les changements dans les ligues. De plus, il propose de nouveaux angles de caméra pour visualiser le terrain de jeu et une nouvelle interface plus intuitive pour les consoles.