A sequela de Kileak: O DNA Imperativo, Epidemia cai jogadores em um mundo atormentado por uma doença mortal: O vírus Gigari. Tendo se espalhado por todo o mundo, ele tem forçado os restos da civilização humana a se esconder no subsolo. Início para a humanidade é a Cidade Neural, que é controlada pelo Grupo Byflos, que detêm a ameaça de desligar todo o suporte de vida sobre as cabeças dos habitantes da cidade. Como Masao Coda, um membro do grupo de libertação Del Sol, você deve usar seu terno Armadura Protect para envolver o Grupo Byflos e seus muitos servos robóticos, resgatar sua namorada infectada da morte certa nas mãos do vírus, e, eventualmente, salvar a humanidade .