Il seguito di Kileak: Il DNA imperativo, Epidemia immerge i giocatori in un mondo afflitto da una malattia mortale: il virus Gigari. Aver diffuso in tutto il mondo, che ha costretto i resti della civiltà umana a nascondersi sottoterra. Home per l'umanità è Neural City, che è controllata dal Gruppo Byflos, che detengono la minaccia di chiudere immediatamente tutti gli supporto vitale sopra le teste degli abitanti della città. Come Masao Coda, un membro del gruppo di liberazione del Sol, è necessario utilizzare la tuta armatura Protect per coinvolgere il gruppo Byflos e dei suoi numerosi seguaci robotici, salvare la tua fidanzata infetto da morte certa per mano dei virus, e, infine, salvare l'umanità .