O jogador controla uma unidade de comando que procura resgatar a sua família raptada, incluindo o seu avô cientista, que é forçado a criar uma arma que dará ao antagonista do jogo, conhecido apenas como "o Comissário", o poder de dominar a Terra.

Na versão para a Sega Mega Drive/Genesis, o comando, conhecido como Johnny Ford, está numa missão a solo para destruir o reinado da entidade conhecida como "O Rei Rubro", que raptou a sua família porque o pai de Johnny, Malcolm Ford, criou um soro que poderia imunizar as pessoas contra os efeitos viciantes das drogas.