Der Spieler übernimmt die Kontrolle über eine Kommandoeinheit, die ihre entführte Familie befreien will, darunter ihren Großvater, einen Wissenschaftler, der gezwungen wird, eine Waffe zu entwickeln, die dem Antagonisten des Spiels, bekannt als „der Kommissar“, die Macht verleiht, die Erde zu beherrschen.

In der Sega Mega Drive/Genesis-Version befindet sich der Kommandosoldat Johnny Ford auf einer Solomission, um die Herrschaft des Wesens namens „Der Scharlachrote König“ zu beenden. Dieser hatte Johnnys Familie entführt, weil sein Vater, Malcolm Ford, ein Serum entwickelt hatte, das Menschen vor der Suchtwirkung von Drogen immunisieren konnte.