Dans Final Fantasy VI, l'histoire d'ouverture raconte l'histoire d'une guerre ancienne qui a eu lieu mille ans dans le passé. Les batailles ont été gagnées et perdues par la puissance de la magie et le conflit est venu à appeler la « Guerre des Mages ». Cette terrible guerre a dévasté la quasi-totalité de l'humanité. Maintenant, des siècles plus tard, toute la magie a disparu des règnes du monde et de haute technologie à sa place. Malgré la puissance et les progrès obtenus grâce à la technologie, il y a ceux qui essaierait de ramener les pouvoirs destructeurs de la magie.