Deep Water est un jeu de tir et d'action solo se déroulant dans un monde post-apocalyptique où l'atmosphère a changé après une catastrophe non précisée. Vous jouez maintenant le rôle d'un jeune homme nommé El Shipak qui chasse les monstres marins pour gagner sa vie. Il y a six mois, Shipak a aperçu un monstre spécial et il est maintenant obsédé par sa chasse. Le gameplay comprend la navigation autour des océans avec le bateau El Shipaks. Dans les océans se trouvent des ports flottants où des fournitures comme du carburant et des munitions peuvent être achetées pour traquer le monstre.