Ex-soldat des Forces spéciales américaines, Jack Carver se retrouve échoué sur un mystérieux archipel en Micronésie à la suite de l'attaque et de la destruction du bateau à bord duquel il transportait et escortait une journaliste. Il part alors à sa recherche mais se rend compte que l'archipel est militairement protégé. Des mercenaires surveillent les îles, sous les ordres d'un scientifique (Krieger) qui poursuit de mystérieuses recherches génétiques sur des primates appelés trigènes.