Il s'agit d'une version améliorée et contient 14 nouvelles chansons, ainsi que six nouvelles chansons téléchargeables pour la version domestique. Alors que dans le jeu original, il n'y avait que trois chansons à choisir à chaque étape, cette version permet au joueur d'en choisir plusieurs.
Le mode "Love Love/Couples", disponible à l'origine uniquement dans la version domestique de Samba de Amigo, est inclus dans la version arcade de Ver. 2000.

Un nouveau personnage nommé Amiga rejoint le casting. Elle est la sœur d'Amigo et manie un tambourin. Dans la version domestique, un nouveau jeu de volleyball remplace les mini-jeux originaux. Le mode Survie a également été ajouté, où le joueur doit terminer autant de chansons d'affilée que possible. De plus, le mode Challenge a de nouveaux objectifs, ainsi que cinq nouvelles étapes secrètes assez difficiles.