Katawa Shoujo est un visual novel du style bishoujo qui prend place dans la fictive Université Yamaku spécialisée pour les enfants handicapés, située quelque part dans le Japon contemporain. Hisao Nakai, un garçon normal vivant une vie normale, voit sa vie bouleversée quand une malformation congénitale au cœur le force à partir dans une nouvelle école après une longue hospitalisation. Malgré ses difficultés, Hisao est en mesure de trouver des amis et peut-être l'amour, s’il joue bien ses cartes. Il y a cinq routes principales correspondant aux cinq filles principales, chaque route suit le scénario se rapportant à ce personnage