Un an s'est écoulé depuis que Kazuma Kiryu, "yakuza au cœur de l'or", a vaincu son plus grand adversaire lors du match précédent. Malgré cette victoire, Kazuma a perdu plus qu'il ne l'avait imaginé.
Mais les événements du passé continuent de le hanter. Un homme qu'il avait tant admiré, qui ressemblait à un père pour lui, a révélé un terrible secret avant sa mort. Il est temps que Kazuma résolve le mystère une fois pour toutes. Pris dans l'éternelle lutte entre Kantou et Kansai, les groupes criminels organisés du Japon oriental et occidental, il se rend vite compte qu'il existe d'autres puissances sur la scène, y compris une mystérieuse organisation coréenne qui semble liée à son passé.