Klonoa, une créature aux longues oreilles, est tombée sur une autre aventure mystique. Dans Klonoa 2, un royaume obscur menace le royaume enchanté de Lunatea. C'est maintenant à Klonoa et à ses amis, Lolo et Popka, d'empêcher les forces du mal d'amener des monstres et des maladies dans leur monde.
Aidez Klonoa à traverser 24 étapes magiques comprenant du vol en hoverboard, des changements de perception et de nouveaux ennemis perfides. Au cours de votre aventure, vous laisserez tomber des cascades, serez tiré en l'air par un canon et gagnerez des capacités spéciales de la part de vos ennemis vaincus.