Le nouveau chapitre de l'histoire de Paper Mario n'est pas seulement hors de ce monde... il est hors de cette dimension. Ce qui, à première vue, semble être un jeu de défilement latéral en 2D tiré directement des pages de l'univers de Paper Mario se transforme rapidement en une action-aventure en 3D qui défie toute logique de jeu vidéo.
Fusionnant les perspectives 2D et 3D, sans parler des éléments de RPG et de plateforme, le jeu glisse entre les dimensions. L'action s'étend sur huit mondes remplis de pièges, d'énigmes, de mystères bizarres et d'objets qui sortent souvent de nulle part. Oh, et ce n'est pas parce que Mario est dans le titre qu'il est la seule star. Les joueurs peuvent également incarner Peach et Bowser.