Si vous pensez savoir ce que cela fait d'être le chasseur de primes derrière la visière, détrompez-vous. Visez le mal avec la manette révolutionnaire de Nintendo. Les joueurs contrôlent Samus en se déplaçant avec le contrôleur Nunchuk et en visant avec le pointeur, permettant un niveau d'immersion sans précédent. À travers les yeux de Samus, les joueurs font un bond en avant dans le contrôle à la première personne en utilisant la télécommande Wii, l'appareil ultime pour le genre de jeu de tir à la première personne.
Samus utilise des bonus bien connus comme le Grapple Beam et le Morph Ball, ainsi qu'un tas de nouvelles surprises, pour l'aider à survivre à ses prochaines épreuves. Mais sauver les planètes de la corruption ne suffit pas. Finalement, les joueurs doivent vaincre l'ennemi mortel de Samus, Dark Samus.