Top Secret se joue sur des écrans individuels, chacun comportant un certain nombre de disques à collecter. Il y a divers ennemis sur l'écran, qui doivent être frappés plusieurs fois avant d'être arrêtés. Les créatures basées au sol peuvent ensuite être marché pour des points, tandis que les oiseaux s'arrêtent simplement pendant quelques secondes. Les schémas de niveaux ressemblent à ceux de Rodland, avec des espaces entre les plates-formes et votre personnage glisse de la même manière. Certains disques sont suspendus dans les airs et vous devez contrôler la chute du personnage pour les éviter. Un certain nombre d'articles bonus sont proposés, notamment des points supplémentaires, des vies supplémentaires et des invincibilités.