Selon la légende égyptienne, Horus, fils de la lumière, a déjoué le dieu maléfique Set et l'a emprisonné dans une tombe secrète. Cinq mille ans plus tard, Lara Croft découvre le tombeau perdu et libère involontairement le maléfique Dieu Set, accomplissant l'ancienne prophétie de son retour pour plonger l'humanité dans les ténèbres !
Dans une course contre la montre, Lara doit utiliser tout son esprit et ses compétences pour réemprisonner Set et sauver le monde d'Armageddon. Poursuivie à chaque tournant par son grand rival, l'archéologue sans scrupules Werner Von Croy, Lara se lance dans un voyage de découverte à travers l'Égypte, où elle doit surmonter les énigmes les plus ingénieuses et les pièges infernaux jamais imaginés, et faire face à un mal terrifiant d'outre-tombe.