Basado en el manga cyberpunk y el anime por Masamune Shirow, Ghost in the Shell se coloca en el cuerpo ágil cyborg del Mayor Motoko Kusanagi, pilotando un vehículo de asalto Fuchikoma como miembro de la Oficina de Seguridad Pública Sección 9. Una organización de asalto encubierta bajo la década de gobierno ala, Sección 9 está diseñado para eliminar la delincuencia y sus causas, así que cuando un grupo de terroristas lanzar un ataque matando a casi un centenar de personas en el proceso, que sale con sus compañeros de equipo en toda su fuerza.