La version Jaguar de Doom a été développée par id Software et publiée par Atari le 28 novembre 1994. A l'instar de la version PC, cette version de Doom a été développée sur la plate-forme NEXTSTEP et compilée pour fonctionner sur la Jaguar. La grosse partie du moteur a été programmée par John Carmack, tandis que Dave Taylor s’occupait du code multijoueur.Cette version était le premier portage officiel de Doom à commencer son cycle de développement, les versions 32X, 3DO, GBA et PlayStation sont tous dérivés de ce port, mais la version 32X ait été publiée en premier.