Yo ! Après avoir été traité comme un déchet par les Tortues Ninja, Shredder a formé une nouvelle race de fantassins, plus impitoyable, pour infliger sa vengeance : Un clan de plus de 700 Tortues Terminators Taekwondo qui ont une fois de plus capturé April O'Neil pour l'utiliser comme appât à tortues. Heureusement, vous n'aurez pas à affronter seul ces monstres de la torture. Pour la première fois, quatre gars ou filles peuvent unir leurs forces et affronter Shredder à deux, en se couvrant l'un l'autre. Mais pour survivre, vous devez vous battre à travers 8 niveaux d'arcade pleins d'action, y compris le parking de Vinnie's Valet "Stalking" et le système d'égouts de Soho, plus deux nouveaux niveaux de destruction de carapace jamais vus auparavant ! Chacun de ces pièges mortels est renforcé par des électro-zappers mortels, des rayons laser, des brûleurs de congélateur ou des ennemis tels que les robots scorpions, les Stone Warriors et Baxter Stockman. Shredder a également engagé les tout-puissants Tora et Shogun, deux chasseurs de primes extraterrestres qui n'ont jamais connu la défaite. Même si Maître Splinter a bien préparé les tortues au combat, leur apprenant de nouveaux mouvements d'attaque radicaux, cela ne signifie pas que cette guerre pour sauver April et l'humanité des tortues sera une partie de plaisir ou même une part de pizza. Car avec les forces de la vengeance de son côté et les chasseurs de primes en ville, c'est l'heure de la revanche pour Shredder !