Mouse Shooter GoGo est un jeu de réflexion dans lequel le joueur contrôle une souris qui peut se déplacer n'importe où sur l'écran fixe et doit lancer des boules colorées sur d'autres boules de la même couleur pour les faire disparaître.
Si vous êtes touché par une boule, vous devrez recommencer le niveau, mais vous pouvez utiliser la boule que vous tenez pour vous protéger des autres boules. Il y a deux boutons, l'un lance la boule, l'autre verrouille/déverrouille la direction. Le jeu propose également un mode deux joueurs en mode versus.