Dans City Bomber, le joueur est à la poursuite d'un gang de criminels. Afin d'empêcher les criminels de s'échapper, le joueur doit atteindre les points de contrôle dans un laps de temps spécifié. Au début du jeu, la voiture du joueur peut tirer des missiles sur des véhicules ennemis et est également capable de sauter par-dessus des ennemis ou des obstacles. Lorsque certaines voitures ennemies sont détruites, des power-ups sont libérés qui augmentent les capacités de la voiture. Les missiles améliorent la puissance destructrice des armes de la voiture, les ailes allongent la distance de saut de la voiture, les propulseurs de roquettes accélèrent la voiture et les scies à air permettent à la voiture de percuter les obstacles sans dommage pendant une courte période.

Les collisions avec d'autres voitures ne sont généralement pas nuisibles pour le joueur, bien qu'elles puissent ralentir la voiture. Les nappes de pétrole lâchées par les ennemis feront tourner la voiture et la ralentiront considérablement. Les collisions avec des obstacles ou la chute du parcours détruiront la voiture du joueur. Bien que le joueur dispose d'un nombre illimité de voitures, les accidents coûteront du temps au joueur et la nouvelle voiture perdra tous les bonus précédemment collectés. Si le joueur n'atteint pas le point de contrôle (indiqué par une carte sur le côté gauche de l'écran) à temps, le jeu est terminé.

Les points sont marqués en détruisant les voitures ennemies, avec des points bonus attribués à la fin de chaque parcours pour le temps restant.