La Terre a été envahie par l'Alliance Orb. Un régime restreint est institué pour les humains qui restent. Les robes de moine sont les seuls vêtements autorisés, la parole est un crime capital, et chaque être humain a été implanté avec une puce suivi enregistrement chacun de leurs mouvements. Pour traquer les criminels, les orbes enrôlent "Manhunters" - les humains à la technologie de pointe et sélectionnés pour être une combinaison d'agents de police et des chasseurs de primes. Le joueur contrôle un Manhunter pour dénouer un complot à l'intérieur des ruines de New York, et un mystérieux serial killer en liberté.