Le scénario de Street Fighter III : 2nd Impact est considéré comme une réécriture des événements de Street Fighter III : New Generation.
Un Troisième Tournoi Mondial de Combat se tient toujours mais de nouveau visages apparaissent, le précédent tournoi ayant eu lieu des années auparavant. Bien que la plupart combattent avec leurs propres motivations et dans un but particulier, des rumeurs circulent quant à l’émergence d’une société secrète suite a la chute de Shadaloo. Certains enquêtent sur elle et toutes les preuves les renvoient vers le Troisième Tournoi mondial.

Street Fighter III: 2nd Impact - Giant Attack reprend les bases posées par Street Fighter III: New Generation. Yun et Yang du premier jeu sont devenus deux personnages différents jouables, Yang a reçu une nouvelle palette de mouvements disposant de coups spéciaux et des supers qui le distinguent de Yun.
Akuma revient en tant que personnage caché et le jeu ajoute notamment une version plus rapide du personnage contrôlée par l'ordinateur, nommée Shin Akuma apparaissant dans le mode solo.