Reaper of Souls prend place dans le monde imaginaire de type médiéval-fantastique de Sanctuaire déjà développé dans les deux premiers opus de la série. Son scénario fait suite à celui du jeu original à la fin duquel le joueur parvenait à vaincre Diablo et à emprisonner son âme dans la pierre noire avec celles des autres démons primordiaux. Au début du jeu, la pierre est dérobé par l’archange Malthael qui souhaite l’utiliser pour détruire l’humanité et mettre fin au conflit opposant anges et démons. L’extension se déroule dans le royaume de l'Ouestmarche, puis dans la forteresse de Pandemonium où Malthael a trouvé refuge.