A história de Crepúsculo Syndrome: Saikai se concentra em quatro adolescentes japoneses: Yuri, sua irmã Masa, e seus amigos Atsushi e Aya. Tudo começa quando os jovens ouvir rumores sobre espíritos contidos no prédio da escola. À noite, Yuri e seus amigos vão para a escola e jogar um jogo-convocação espírito. De repente, fantasmas reais aparecer e assustar os adolescentes de distância. No dia seguinte, Yuri está quase pronto para acreditar que era tudo um sonho ... mas, naturalmente, não era. Os segredos das almas perdidas vão ser revelados apenas para aqueles que possuem um sentido especial - a Síndrome do Crepúsculo ..