La historia de Crepúsculo Síndrome: Saikai se centra en cuatro adolescentes japoneses: Yuri, su hermana Masa, y sus amigos y Atsushi Aya. Todo comienza cuando los jóvenes escuchan rumores sobre espíritus contenidas en el edificio de la escuela. Por la noche, Yuri y sus amigos van a la escuela y jugar un juego espíritu invocación. De repente, fantasmas reales aparecen y asustar a los adolescentes de distancia. Al día siguiente, Yuri está casi listo para creer que todo era un sueño ... pero, naturalmente, no lo era. Los oscuros secretos de las almas perdidas van a ser revelada sólo a aquellos que poseen un sentido especial - el síndrome de Crepúsculo ..